Mikroorganizmalar, gözle görülemeyecek kadar küçük canlılardır. Bakteriler, virüsler, mantarlar ve protozoalar gibi çeşitli türleri içerirler. Genellikle tek hücreli olsalar da, bazıları çok hücreli olabilir.
Mikroorganizmalar, doğada yaygın olarak bulunurlar; toprakta, suda, havada ve hatta diğer canlıların içinde veya üzerinde yaşayabilirler. Besin zincirinin önemli bir parçasıdırlar ve ekosistemlerin dengesinde kritik rol oynarlar.
Mikroorganizmaların hem yararlı hem de zararlı etkileri olabilir:
Mikroorganizmaların incelenmesi Mikrobiyoloji bilimi tarafından yapılır. Mikrobiyoloji, tıp, gıda endüstrisi, ziraat ve çevre bilimi gibi birçok alanda önemli uygulamalara sahiptir.